Sluitstuk van de planning- en controlcyclus is de jaarrekening. Het financieel jaarverslag (de jaarrekening) is een onderdeel van het jaarverslag waarin het bestuur van de universiteit verantwoording aflegt over de activiteiten in het afgelopen jaar.

De jaarrekening is ingericht volgens de normen van het ministerie van Onderwijs en Wetenschappen en wordt gecontroleerd door een accountant. Nadat het vierde kwartaal van het jaar is afgesloten kan ook de afronding in de vorm van de jaarrekening volgen. Daarbij wordt een strakke planning gemaakt om te bereiken dat de uiteindelijke vaststelling door de Raad van Toezicht omstreeks april/mei kan volgen (planning 2008).

Een werkgroep binnen DFEZ-centraal volgt de voortgang en de ontwikkelingen. Deze werkgroep is samengesteld uit het hoofd/directeur DFEZ, de afdelingshoofden van de boekhouding en planning & control en enkele medewerkers van DFEZ-centraal.

Vastgesteld moet worden dat alle relevante boekingen door de eenheden zijn aangeleverd en geboekt. Kritische posten zoals de waardering van het onderhanden werk, de ramingen voor overlopende vorderingen en verplichtingen, de afloop van oudere balansposten krijgen extra aandacht. Voor een deel worden gerichte controles uitgevoerd.

Op diverse plaatsen worden aansluitingen en onderbouwingen van posten gedocumenteerd. Voorbeelden zijn de aansluitingen tussen de het grootboek en o.a. de activa-administratie, de salarisadministratie, onderhanden werk, specificaties van debiteuren, crediteuren, nog te ontvangen en nog te betalen bedragen, van de diverse kosten enzovoort. De externe accountant maakt daar vervolgens gebruik van voor de controle.

Naast het cijfermatige deel verzorgt de werkgroep ook de toelichtende teksten in de jaarrekening.

Parallel met de afronding verloopt de accountantscontrole. Waar nodig worden tot het laatste moment nog aanpassingen in de cijfers en/of de toelichtingen doorgevoerd. Vervolgens wordt de jaarrekening naar het College van Bestuur gestuurd. Het CvB biedt daarna de jaarrekening als onderdeel van het jaarverslag aan aan de Raad van Toezicht. De RvT stelt vervolgens de jaarrekening vast.

Het jaarverslag inclusief de jaarrekening is het formele document en omvat de totale activiteiten in het verslagjaar.